Samsung Galaxy Z Fold3 終於加入 S Pen 支援，對於愛好使用筆控，以及認為 S Pen 在於繪圖記事相當方便的用戶來說，的確是一大喜訊。不過今次其實是一次過支援兩款，事關廠方推出了 S Pen Fold Edition 及 S Pen Pro ，以滿足用戶對 S Pen 不同程度的需求。
為了針對柔性屏幕觸控需求， Samsung 特意開發出新的 S Pen Fold Edition ，利用柔軟物料製作筆頭及加入可伸縮筆尖和限力技術，令用戶在 Samsung Galaxy Z Fold3 上書寫都可有像使用 Galaxy Note 系列手機時的體驗。雖然 S Pen Fold Edition 不是很大支，但因機身設計令 Samsung Galaxy Z Fold3 未像 Galaxy Note 系列手機可將觸控筆收納於機身內，要隨身攜帶 S Pen 配合使用，最好就一併入手專用的保護套了。
至於 S Pen Pro 則是為擁有多個 Galaxy 裝置的朋友而設的一款觸控筆， S Pen Pro 大小像 HB 鉛筆，筆尾有 USB-C 介面作充電用，而且更可選擇兩個模式： Fold S Pen 是針對使用 Galaxy Z Fold3 場景時選擇，選擇 S Pen 模式則可將此筆用於 Galaxy S21 系列及 Galaxy s7 Tab 等裝置上，而且內置藍牙連接功能，一旦遺失可利用 SmartThings Find 功能定位找回。